Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms