Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms