Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT1Q9NXH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT1Q9NXH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms