Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms