Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms