Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC17Q9NVM6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC17Q9NVM6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms