Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARVAQ9NVD7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms