Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MED17Q9NVC6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms