Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms