Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC177Q9NQR7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms