Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX9Q9NQ69 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms