Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VTA1Q9NP79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms