Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFGAP3Q9NP61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms