Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms