Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C6orf50Q9HD87 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf50Q9HD87 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms