Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM8AQ9HCN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM8AQ9HCN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms