Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms