Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR41Q9HAD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR41Q9HAD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms