Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC52A2Q9HAB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC52A2Q9HAB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms