Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1Q9H7V2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms