Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms