Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP4BQ9H444 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BQ9H444 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms