Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF39Q9H2S5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms