Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms