Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTBN4Q9H254 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN4Q9H254 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms