Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COMMD5Q9GZQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COMMD5Q9GZQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms