Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTR3CQ9C0K3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms