Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms