Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASXL3Q9C0F0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASXL3Q9C0F0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms