Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP4Q9BZE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms