Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms