Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms