Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSG1Q9BU20 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms