Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms