Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms