Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms