Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOPXQ9BPY8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOPXQ9BPY8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOPXQ9BPY8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOPXQ9BPY8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOPXQ9BPY8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms