Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYD88Q99836 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms