Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIT2Q99578 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIT2Q99578 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT2Q99578 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT2Q99578 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms