Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1Q99536 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1Q99536 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms