Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOTCH4Q99466 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NOTCH4Q99466 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms