Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF1Q96T88 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UHRF1Q96T88 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms