Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBGCP6Q96RT7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBGCP6Q96RT7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBGCP6Q96RT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms