Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms