Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RDH12Q96NR8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms