Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNBD2Q96M20 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms