Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC17Q96LX7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms