Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms