Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMEM87BQ96K49 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.7 ms