Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms